Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCANQ96GW7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms