Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX27Q96GQ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms