Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms