Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC155Q8N6L0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms