Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VSIG10Q8N0Z9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSIG10Q8N0Z9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms