Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms