Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms