Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms