Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms