Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf53Q5VUE5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms