Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc69Q3TCJ8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms