Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms