Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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