Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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