Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP7Q16576 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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