Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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