Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms