Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD3Q12873 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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