Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TROQ12816 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TROQ12816 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TROQ12816 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TROQ12816 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TROQ12816 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TROQ12816 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TROQ12816 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TROQ12816 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TROQ12816 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TROQ12816 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TROQ12816 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TROQ12816 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TROQ12816 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TROQ12816 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TROQ12816 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TROQ12816 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TROQ12816 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TROQ12816 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TROQ12816 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TROQ12816 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TROQ12816 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TROQ12816 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TROQ12816 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TROQ12816 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TROQ12816 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TROQ12816 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TROQ12816 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TROQ12816 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TROQ12816 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TROQ12816 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TROQ12816 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TROQ12816 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TROQ12816 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TROQ12816 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TROQ12816 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TROQ12816 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TROQ12816 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TROQ12816 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TROQ12816 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TROQ12816 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TROQ12816 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TROQ12816 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TROQ12816 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TROQ12816 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TROQ12816 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TROQ12816 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TROQ12816 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TROQ12816 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TROQ12816 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TROQ12816 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TROQ12816 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TROQ12816 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TROQ12816 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TROQ12816 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.77
TROQ12816 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.77
TROQ12816 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
TROQ12816 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TROQ12816 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TROQ12816 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TROQ12816 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TROQ12816 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TROQ12816 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TROQ12816 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TROQ12816 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TROQ12816 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TROQ12816 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TROQ12816 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TROQ12816 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TROQ12816 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TROQ12816 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TROQ12816 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TROQ12816 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TROQ12816 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TROQ12816 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TROQ12816 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TROQ12816 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TROQ12816 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TROQ12816 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TROQ12816 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TROQ12816 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TROQ12816 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TROQ12816 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TROQ12816 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TROQ12816 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TROQ12816 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TROQ12816 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TROQ12816 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TROQ12816 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TROQ12816 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TROQ12816 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TROQ12816 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TROQ12816 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TROQ12816 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TROQ12816 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TROQ12816 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TROQ12816 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TROQ12816 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TROQ12816 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TROQ12816 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms