Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 MRH1YDR033W 963 nt2.91□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YGL152CYGL152C 678 nt2.91□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 CHO2YGR157W 2610 nt2.91□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 CWC22YGR278W 1734 nt2.9□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 AKR1YDR264C 2295 nt2.9□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 UTP14YML093W 2700 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 PMR1YGL167C 2853 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YCR016WYCR016W 873 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 SHR3YDL212W 633 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YIL141WYIL141W 390 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 SFT1YKL006C-A 294 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 MTG1YMR097C 1104 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 SRT1YMR101C 1032 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 ATG19YOL082W 1248 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 DIM1YPL266W 957 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YLR001CYLR001C 2589 nt2.9□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 JJJ1YNL227C 1773 nt2.89□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 CEP3YMR168C 1827 nt2.89□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 MIG2YGL209W 1149 nt2.89□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 AGE2YIL044C 897 nt2.89□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.89□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 RPL17BYJL177W 555 nt2.89□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 SFH1YLR321C 1281 nt2.89□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 AEP1YMR064W 1557 nt2.89□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 UBS1YBR165W 834 nt2.89□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YBP2YGL060W 1926 nt2.89□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 PIG2YIL045W 1617 nt2.89□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 BIT61YJL058C 1632 nt2.89□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 PSY4YBL046W 1326 nt2.89□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 APC11YDL008W 498 nt2.88□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 FMP32YFL046W 624 nt2.88□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 CDC26YFR036W 375 nt2.88□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 LSM12YHR121W 564 nt2.88□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YJL032WYJL032W 315 nt2.88□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt2.88□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 MRPS8YMR158W 468 nt2.88□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YPL107WYPL107W 747 nt2.88□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 ACM1YPL267W 630 nt2.88□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 ECM21YBL101C 3354 nt2.88□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 JJJ2YJL162C 1752 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 OPI6YDL096C 327 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 RSM24YDR175C 960 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 HLR1YDR528W 1272 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YGR017WYGR017W 894 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 ALB1YJL122W 528 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 HYM1YKL189W 1200 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 FAR3YMR052W 615 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 RCE1YMR274C 948 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 DIA1YMR316W 1011 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 HSP10YOR020C 321 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 CUP9YPL177C 921 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 NMD2YHR077C 3270 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 SGM1YJR134C 2124 nt2.87□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 MOT1YPL082C 5604 nt2.86□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YGL039WYGL039W 1047 nt2.86□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YGL242CYGL242C 546 nt2.86□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YGR111WYGR111W 1203 nt2.86□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 GTR2YGR163W 1026 nt2.86□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 LIP2YLR239C 987 nt2.86□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.86□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 MRPL17YNL252C 846 nt2.86□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 PEX34YCL056C 435 nt2.86□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 LRG1YDL240W 3054 nt2.86□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 MDM1YML104C 3384 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 RPN9YDR427W 1182 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 ERV1YGR029W 570 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 RPL24BYGR148C 468 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YLR297WYLR297W 390 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 MRPL16YBL038W 699 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 AIM36YMR157C 768 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YMR181CYMR181C 465 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 NGL1YOL042W 1092 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YOR366WYOR366W 354 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 DUG2YBR281C 2637 nt2.85□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 VHR1YIL056W 1923 nt2.84□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 GUK1YDR454C 564 nt2.84□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 MAM1YER106W 909 nt2.84□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YER138W-AYER138W-A 105 nt2.84□□□□□ -1.95
NFI1Q12216 YFR054CYFR054C 579 nt2.84□□□□□ -1.95
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