Protein–RNA interactions for Protein: Q08412

CUE5, Ubiquitin-binding protein CUE5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE5Q08412 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE5Q08412 UPF3YGR072W 1164 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE5Q08412 COX6YHR051W 447 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE5Q08412 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE5Q08412 NNF1YJR112W 606 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE5Q08412 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE5Q08412 YNL203CYNL203C 612 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE5Q08412 CBP6YBR120C 489 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE5Q08412 URB2YJR041C 3525 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE5Q08412 YNL011CYNL011C 1335 nt3.09□□□□□ -1.91
CUE5Q08412 NUR1YDL089W 1455 nt3.09□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 SPO71YDR104C 3738 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 PEX5YDR244W 1839 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 ATP16YDL004W 483 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 RPL13AYDL082W 600 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 HMO1YDR174W 741 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 RSM27YGR215W 333 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 MRPL38YKL170W 417 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 DAD2YKR083C 402 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 SUB1YMR039C 879 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 DOA4YDR069C 2781 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 FRE2YKL220C 2136 nt3.08□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 MET5YJR137C 4329 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 KHA1YJL094C 2622 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 PDS5YMR076C 3834 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 GPM2YDL021W 936 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 BTN2YGR142W 1233 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YHR054CYHR054C 1065 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 DAL2YIR029W 1032 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 VMA6YLR447C 1038 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 DLT1YMR126C 1029 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 ATP20YPR020W 348 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 PSY2YNL201C 2577 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 RSN1YMR266W 2862 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 FLO1YAR050W 4614 nt3.07□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 BMH2YDR099W 822 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 HEH2YDR458C 1992 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 MET6YER091C 2304 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 OST5YGL226C-A 261 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 RPN1YHR027C 2982 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YJL032WYJL032W 315 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 SAG1YJR004C 1953 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 SDH3YKL141W 597 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YBL065WYBL065W 345 nt3.06□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 FAR1YJL157C 2493 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 VPS33YLR396C 2076 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 NET1YJL076W 3570 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 POL3YDL102W 3294 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 MSH4YFL003C 2637 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 MSB2YGR014W 3921 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 RUB1YDR139C 234 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YDR193WYDR193W 399 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 MFA1YDR461W 111 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YDR509WYDR509W 348 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YEA4YEL004W 1029 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YGL242CYGL242C 546 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 CCE1YKL011C 1062 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YKL131WYKL131W 522 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 PIR1YKL164C 1026 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 SFH1YLR321C 1281 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YNL050CYNL050C 813 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 RCY1YJL204C 2523 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 SYO1YDL063C 1863 nt3.05□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 AI4Q0065 1671 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 UTP5YDR398W 1932 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YGL159WYGL159W 1113 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YGR160WYGR160W 612 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 REC102YLR329W 795 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 RPL6BYLR448W 531 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 MRPL16YBL038W 699 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YNL043CYNL043C 321 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 RPL20BYOR312C 519 nt3.04□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 APM3YBR288C 1452 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YPD1YDL235C 504 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 DPP1YDR284C 870 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YFH7YFR007W 1062 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YHL005CYHL005C 393 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YHR180WYHR180W 492 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 SVP26YHR181W 687 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YLR297WYLR297W 390 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 RPL19BYBL027W 570 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 INP1YMR204C 1263 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 RPL20AYMR242C 519 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 MIC27YNL100W 705 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 TIM12YBR091C 330 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YGL176CYGL176C 1665 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 YDR061WYDR061W 1620 nt3.03□□□□□ -1.92
CUE5Q08412 GCD6YDR211W 2139 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE5Q08412 STE6YKL209C 3873 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE5Q08412 MDM36YPR083W 1740 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE5Q08412 HTB1YDR224C 396 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE5Q08412 YGR107WYGR107W 450 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE5Q08412 YJL169WYJL169W 369 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE5Q08412 UNG1YML021C 1080 nt3.02□□□□□ -1.93
CUE5Q08412 PRM6YML047C 1059 nt3.02□□□□□ -1.93
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