Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms