Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK16Q00536 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK16Q00536 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK16Q00536 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK16Q00536 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK16Q00536 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK16Q00536 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK16Q00536 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK16Q00536 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK16Q00536 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK16Q00536 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK16Q00536 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK16Q00536 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK16Q00536 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK16Q00536 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK16Q00536 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK16Q00536 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK16Q00536 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK16Q00536 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK16Q00536 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK16Q00536 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK16Q00536 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK16Q00536 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK16Q00536 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK16Q00536 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK16Q00536 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK16Q00536 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK16Q00536 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK16Q00536 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK16Q00536 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK16Q00536 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK16Q00536 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK16Q00536 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK16Q00536 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK16Q00536 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms