Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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