Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab4aP56371 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms