Protein–RNA interactions for Protein: P55000

SLURP1, Secreted Ly-6/uPAR-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLURP1P55000 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLURP1P55000 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms