Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBP50607 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBP50607 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBP50607 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBP50607 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBP50607 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms