Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARRES1P49788 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms