Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGCXP38435 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GGCXP38435 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GGCXP38435 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGCXP38435 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGCXP38435 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGCXP38435 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGCXP38435 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGCXP38435 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGCXP38435 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms