Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 CHK1YBR274W 1584 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 FIN1YDR130C 876 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YDR149CYDR149C 708 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YDR157WYDR157W 402 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 CIC1YHR052W 1131 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 ATG10YLL042C 504 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 BUR2YLR226W 1188 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YPR012WYPR012W 255 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 WHI3YNL197C 1986 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 SEC27YGL137W 2670 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 DRS2YAL026C 4068 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 TCP1YDR212W 1680 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 TMA108YIL137C 2841 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YLR177WYLR177W 1887 nt2.96□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YDR089WYDR089W 2610 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 SPO23YBR250W 1572 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 PEA2YER149C 1263 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 FUR1YHR128W 651 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YIL029CYIL029C 429 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 EAF6YJR082C 342 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 UTP11YKL099C 753 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 RPL17AYKL180W 555 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 UNG1YML021C 1080 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 COQ5YML110C 924 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YNL235CYNL235C 432 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YNL324WYNL324W 396 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 THR4YCR053W 1545 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 ROM1YGR070W 3468 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 CDC45YLR103C 1953 nt2.96□□□□□ -1.94
AVT5P38176 CLB3YDL155W 1284 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 PPH3YDR075W 927 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 SEC4YFL005W 648 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YGR045CYGR045C 363 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YHR097CYHR097C 1101 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YHR213WYHR213W 597 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 COQ9YLR201C 783 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YAR062WYAR062W 597 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 MRPL44YMR225C 297 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 INN1YNL152W 1230 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 TOA1YOR194C 861 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 FAR1YJL157C 2493 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YCT1YLL055W 1596 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 PIN4YBL051C 2007 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 MRH4YGL064C 1686 nt2.95□□□□□ -1.94
AVT5P38176 SPO71YDR104C 3738 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 VPS33YLR396C 2076 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 PBP4YDL053C 558 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YPD1YDL235C 504 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 MIX14YDR031W 366 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 SLU7YDR088C 1149 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 IGO2YHR132W-A 396 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 SRP21YKL122C 504 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 SDH3YKL141W 597 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YLL044WYLL044W 447 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 OCA2YNL056W 594 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 ATX2YOR079C 942 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 PRM3YPL192C 402 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 SLY41YOR307C 1362 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 ZDS2YML109W 2829 nt2.94□□□□□ -1.94
AVT5P38176 XRN1YGL173C 4587 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 RNR1YER070W 2667 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 JJJ1YNL227C 1773 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 TMA64YDR117C 1698 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YKL075CYKL075C 1353 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 ECM11YDR446W 909 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 UPF3YGR072W 1164 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 LRP1YHR081W 555 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 SDL1YIL167W 633 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YKL070WYKL070W 510 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YMR087WYMR087W 855 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YPR170CYPR170C 336 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 ARO1YDR127W 4767 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 RGL1YPL066W 1440 nt2.93□□□□□ -1.94
AVT5P38176 MDN1YLR106C 14733 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 GDS1YOR355W 1569 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 KAP104YBR017C 2757 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 PET54YGR222W 882 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 RGI2YIL057C 495 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 NNF1YJR112W 606 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 NFU1YKL040C 771 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 SYM1YLR251W 594 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YLR252WYLR252W 306 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 YNL046WYNL046W 519 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 ASI2YNL159C 870 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 RPA43YOR340C 981 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 DUN1YDL101C 1542 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 TOP1YOL006C 2310 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 EXO70YJL085W 1872 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 RDS1YCR106W 2499 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT5P38176 KIN3YAR018C 1308 nt2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 127.3 ms