Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB2P35606 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB2P35606 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB2P35606 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPB2P35606 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB2P35606 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB2P35606 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB2P35606 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB2P35606 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB2P35606 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB2P35606 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB2P35606 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB2P35606 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB2P35606 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB2P35606 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB2P35606 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB2P35606 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB2P35606 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB2P35606 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB2P35606 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB2P35606 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB2P35606 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB2P35606 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB2P35606 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB2P35606 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB2P35606 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB2P35606 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB2P35606 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB2P35606 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB2P35606 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB2P35606 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB2P35606 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB2P35606 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms