Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms