Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDSP20132 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDSP20132 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDSP20132 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDSP20132 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDSP20132 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDSP20132 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDSP20132 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDSP20132 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDSP20132 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDSP20132 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDSP20132 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDSP20132 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDSP20132 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDSP20132 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDSP20132 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SDSP20132 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDSP20132 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SDSP20132 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDSP20132 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDSP20132 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SDSP20132 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDSP20132 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDSP20132 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDSP20132 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDSP20132 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDSP20132 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDSP20132 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDSP20132 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDSP20132 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDSP20132 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SDSP20132 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms