Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms