Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP1P09874 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP1P09874 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP1P09874 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP1P09874 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP1P09874 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP1P09874 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP1P09874 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARP1P09874 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARP1P09874 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP1P09874 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP1P09874 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP1P09874 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP1P09874 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP1P09874 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP1P09874 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP1P09874 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP1P09874 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP1P09874 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP1P09874 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP1P09874 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP1P09874 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP1P09874 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP1P09874 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP1P09874 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP1P09874 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP1P09874 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP1P09874 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP1P09874 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP1P09874 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP1P09874 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP1P09874 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP1P09874 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP1P09874 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms