Protein–RNA interactions for Protein: P00352

ALDH1A1, Retinal dehydrogenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A1P00352 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A1P00352 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A1P00352 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A1P00352 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A1P00352 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A1P00352 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A1P00352 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALDH1A1P00352 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALDH1A1P00352 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALDH1A1P00352 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALDH1A1P00352 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms