Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF1O43189 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF1O43189 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF1O43189 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF1O43189 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF1O43189 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF1O43189 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF1O43189 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF1O43189 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF1O43189 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF1O43189 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF1O43189 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF1O43189 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF1O43189 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF1O43189 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF1O43189 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF1O43189 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF1O43189 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF1O43189 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF1O43189 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF1O43189 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms