Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms