Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms