Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J269

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J269 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J269 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J269 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J269 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J269 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J269 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J269 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J269 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J269 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0B4J269 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J269 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms