Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Robo3Q9Z2I4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Robo3Q9Z2I4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Robo3Q9Z2I4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Robo3Q9Z2I4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo3Q9Z2I4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo3Q9Z2I4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo3Q9Z2I4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Robo3Q9Z2I4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Robo3Q9Z2I4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Robo3Q9Z2I4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Robo3Q9Z2I4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Robo3Q9Z2I4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Robo3Q9Z2I4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Robo3Q9Z2I4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Robo3Q9Z2I4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Robo3Q9Z2I4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Robo3Q9Z2I4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Robo3Q9Z2I4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Robo3Q9Z2I4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Robo3Q9Z2I4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Robo3Q9Z2I4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Robo3Q9Z2I4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Robo3Q9Z2I4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Robo3Q9Z2I4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Robo3Q9Z2I4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Robo3Q9Z2I4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Robo3Q9Z2I4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Robo3Q9Z2I4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Robo3Q9Z2I4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo3Q9Z2I4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Robo3Q9Z2I4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo3Q9Z2I4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo3Q9Z2I4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo3Q9Z2I4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo3Q9Z2I4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Robo3Q9Z2I4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Robo3Q9Z2I4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo3Q9Z2I4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo3Q9Z2I4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Robo3Q9Z2I4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Robo3Q9Z2I4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Robo3Q9Z2I4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Robo3Q9Z2I4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Robo3Q9Z2I4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Robo3Q9Z2I4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Robo3Q9Z2I4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Robo3Q9Z2I4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Robo3Q9Z2I4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Robo3Q9Z2I4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Robo3Q9Z2I4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Robo3Q9Z2I4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Robo3Q9Z2I4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Robo3Q9Z2I4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Robo3Q9Z2I4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Robo3Q9Z2I4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Robo3Q9Z2I4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Robo3Q9Z2I4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Robo3Q9Z2I4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Robo3Q9Z2I4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Robo3Q9Z2I4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Robo3Q9Z2I4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Robo3Q9Z2I4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Robo3Q9Z2I4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Robo3Q9Z2I4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Robo3Q9Z2I4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Robo3Q9Z2I4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Robo3Q9Z2I4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Robo3Q9Z2I4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Robo3Q9Z2I4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms