Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stau1Q9Z108 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stau1Q9Z108 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stau1Q9Z108 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stau1Q9Z108 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stau1Q9Z108 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stau1Q9Z108 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stau1Q9Z108 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stau1Q9Z108 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stau1Q9Z108 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stau1Q9Z108 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stau1Q9Z108 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stau1Q9Z108 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stau1Q9Z108 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stau1Q9Z108 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stau1Q9Z108 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stau1Q9Z108 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stau1Q9Z108 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stau1Q9Z108 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stau1Q9Z108 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Stau1Q9Z108 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stau1Q9Z108 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stau1Q9Z108 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stau1Q9Z108 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stau1Q9Z108 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stau1Q9Z108 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stau1Q9Z108 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stau1Q9Z108 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Stau1Q9Z108 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stau1Q9Z108 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stau1Q9Z108 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stau1Q9Z108 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stau1Q9Z108 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stau1Q9Z108 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stau1Q9Z108 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stau1Q9Z108 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Stau1Q9Z108 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stau1Q9Z108 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stau1Q9Z108 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stau1Q9Z108 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stau1Q9Z108 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stau1Q9Z108 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stau1Q9Z108 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stau1Q9Z108 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stau1Q9Z108 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stau1Q9Z108 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stau1Q9Z108 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stau1Q9Z108 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stau1Q9Z108 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stau1Q9Z108 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stau1Q9Z108 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stau1Q9Z108 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stau1Q9Z108 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stau1Q9Z108 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stau1Q9Z108 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stau1Q9Z108 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Stau1Q9Z108 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stau1Q9Z108 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stau1Q9Z108 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stau1Q9Z108 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stau1Q9Z108 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stau1Q9Z108 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stau1Q9Z108 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stau1Q9Z108 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stau1Q9Z108 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stau1Q9Z108 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Stau1Q9Z108 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stau1Q9Z108 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stau1Q9Z108 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stau1Q9Z108 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stau1Q9Z108 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stau1Q9Z108 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stau1Q9Z108 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms