Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snx1Q9WV80 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx1Q9WV80 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx1Q9WV80 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx1Q9WV80 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx1Q9WV80 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx1Q9WV80 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx1Q9WV80 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx1Q9WV80 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx1Q9WV80 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx1Q9WV80 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx1Q9WV80 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx1Q9WV80 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx1Q9WV80 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snx1Q9WV80 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx1Q9WV80 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx1Q9WV80 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx1Q9WV80 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx1Q9WV80 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx1Q9WV80 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx1Q9WV80 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx1Q9WV80 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx1Q9WV80 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx1Q9WV80 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx1Q9WV80 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx1Q9WV80 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx1Q9WV80 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx1Q9WV80 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx1Q9WV80 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx1Q9WV80 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx1Q9WV80 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx1Q9WV80 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx1Q9WV80 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx1Q9WV80 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx1Q9WV80 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx1Q9WV80 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx1Q9WV80 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx1Q9WV80 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx1Q9WV80 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx1Q9WV80 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx1Q9WV80 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx1Q9WV80 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx1Q9WV80 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx1Q9WV80 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx1Q9WV80 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx1Q9WV80 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx1Q9WV80 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx1Q9WV80 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx1Q9WV80 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx1Q9WV80 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx1Q9WV80 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx1Q9WV80 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx1Q9WV80 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx1Q9WV80 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms