Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gabbr1Q9WV18 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gabbr1Q9WV18 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gabbr1Q9WV18 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gabbr1Q9WV18 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gabbr1Q9WV18 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gabbr1Q9WV18 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gabbr1Q9WV18 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gabbr1Q9WV18 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gabbr1Q9WV18 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gabbr1Q9WV18 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gabbr1Q9WV18 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gabbr1Q9WV18 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gabbr1Q9WV18 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gabbr1Q9WV18 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Gabbr1Q9WV18 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gabbr1Q9WV18 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gabbr1Q9WV18 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gabbr1Q9WV18 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gabbr1Q9WV18 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gabbr1Q9WV18 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gabbr1Q9WV18 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gabbr1Q9WV18 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gabbr1Q9WV18 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gabbr1Q9WV18 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gabbr1Q9WV18 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gabbr1Q9WV18 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gabbr1Q9WV18 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gabbr1Q9WV18 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gabbr1Q9WV18 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gabbr1Q9WV18 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gabbr1Q9WV18 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gabbr1Q9WV18 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gabbr1Q9WV18 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gabbr1Q9WV18 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gabbr1Q9WV18 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Gabbr1Q9WV18 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gabbr1Q9WV18 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gabbr1Q9WV18 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gabbr1Q9WV18 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gabbr1Q9WV18 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gabbr1Q9WV18 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gabbr1Q9WV18 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gabbr1Q9WV18 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gabbr1Q9WV18 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gabbr1Q9WV18 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gabbr1Q9WV18 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gabbr1Q9WV18 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gabbr1Q9WV18 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gabbr1Q9WV18 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gabbr1Q9WV18 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gabbr1Q9WV18 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gabbr1Q9WV18 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gabbr1Q9WV18 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gabbr1Q9WV18 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gabbr1Q9WV18 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gabbr1Q9WV18 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gabbr1Q9WV18 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gabbr1Q9WV18 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gabbr1Q9WV18 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gabbr1Q9WV18 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gabbr1Q9WV18 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gabbr1Q9WV18 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gabbr1Q9WV18 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms