Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Stub1Q9WUD1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stub1Q9WUD1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stub1Q9WUD1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stub1Q9WUD1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stub1Q9WUD1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stub1Q9WUD1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stub1Q9WUD1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stub1Q9WUD1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stub1Q9WUD1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stub1Q9WUD1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stub1Q9WUD1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stub1Q9WUD1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stub1Q9WUD1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stub1Q9WUD1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stub1Q9WUD1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stub1Q9WUD1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stub1Q9WUD1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stub1Q9WUD1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stub1Q9WUD1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stub1Q9WUD1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stub1Q9WUD1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stub1Q9WUD1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stub1Q9WUD1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stub1Q9WUD1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stub1Q9WUD1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stub1Q9WUD1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stub1Q9WUD1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stub1Q9WUD1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stub1Q9WUD1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stub1Q9WUD1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stub1Q9WUD1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stub1Q9WUD1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stub1Q9WUD1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stub1Q9WUD1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stub1Q9WUD1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stub1Q9WUD1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stub1Q9WUD1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stub1Q9WUD1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stub1Q9WUD1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stub1Q9WUD1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stub1Q9WUD1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stub1Q9WUD1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms