Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TapbpQ9R233 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TapbpQ9R233 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TapbpQ9R233 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TapbpQ9R233 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TapbpQ9R233 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TapbpQ9R233 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TapbpQ9R233 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TapbpQ9R233 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TapbpQ9R233 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TapbpQ9R233 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TapbpQ9R233 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TapbpQ9R233 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TapbpQ9R233 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TapbpQ9R233 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TapbpQ9R233 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TapbpQ9R233 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TapbpQ9R233 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TapbpQ9R233 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TapbpQ9R233 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TapbpQ9R233 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TapbpQ9R233 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TapbpQ9R233 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TapbpQ9R233 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TapbpQ9R233 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TapbpQ9R233 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TapbpQ9R233 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TapbpQ9R233 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TapbpQ9R233 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TapbpQ9R233 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TapbpQ9R233 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TapbpQ9R233 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TapbpQ9R233 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms