Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2afyQ9QZQ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2afyQ9QZQ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2afyQ9QZQ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2afyQ9QZQ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2afyQ9QZQ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2afyQ9QZQ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2afyQ9QZQ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2afyQ9QZQ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2afyQ9QZQ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2afyQ9QZQ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2afyQ9QZQ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2afyQ9QZQ8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
H2afyQ9QZQ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
H2afyQ9QZQ8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2afyQ9QZQ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2afyQ9QZQ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2afyQ9QZQ8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2afyQ9QZQ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2afyQ9QZQ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2afyQ9QZQ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2afyQ9QZQ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2afyQ9QZQ8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2afyQ9QZQ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2afyQ9QZQ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2afyQ9QZQ8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2afyQ9QZQ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
H2afyQ9QZQ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2afyQ9QZQ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2afyQ9QZQ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
H2afyQ9QZQ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2afyQ9QZQ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2afyQ9QZQ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2afyQ9QZQ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2afyQ9QZQ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2afyQ9QZQ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2afyQ9QZQ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2afyQ9QZQ8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2afyQ9QZQ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2afyQ9QZQ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afyQ9QZQ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afyQ9QZQ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afyQ9QZQ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2afyQ9QZQ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2afyQ9QZQ8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms