Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prg4Q9JM99 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prg4Q9JM99 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prg4Q9JM99 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prg4Q9JM99 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prg4Q9JM99 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prg4Q9JM99 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prg4Q9JM99 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prg4Q9JM99 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prg4Q9JM99 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prg4Q9JM99 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prg4Q9JM99 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prg4Q9JM99 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prg4Q9JM99 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prg4Q9JM99 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prg4Q9JM99 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prg4Q9JM99 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prg4Q9JM99 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prg4Q9JM99 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prg4Q9JM99 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prg4Q9JM99 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prg4Q9JM99 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prg4Q9JM99 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prg4Q9JM99 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prg4Q9JM99 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prg4Q9JM99 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prg4Q9JM99 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg4Q9JM99 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prg4Q9JM99 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prg4Q9JM99 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prg4Q9JM99 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prg4Q9JM99 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prg4Q9JM99 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prg4Q9JM99 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prg4Q9JM99 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prg4Q9JM99 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prg4Q9JM99 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prg4Q9JM99 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prg4Q9JM99 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prg4Q9JM99 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prg4Q9JM99 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prg4Q9JM99 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prg4Q9JM99 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prg4Q9JM99 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prg4Q9JM99 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prg4Q9JM99 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prg4Q9JM99 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prg4Q9JM99 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prg4Q9JM99 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prg4Q9JM99 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prg4Q9JM99 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prg4Q9JM99 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prg4Q9JM99 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prg4Q9JM99 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prg4Q9JM99 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prg4Q9JM99 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prg4Q9JM99 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prg4Q9JM99 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prg4Q9JM99 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prg4Q9JM99 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prg4Q9JM99 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prg4Q9JM99 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg4Q9JM99 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg4Q9JM99 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prg4Q9JM99 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prg4Q9JM99 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prg4Q9JM99 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prg4Q9JM99 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms