Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stx6Q9JKK1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stx6Q9JKK1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stx6Q9JKK1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stx6Q9JKK1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stx6Q9JKK1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stx6Q9JKK1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stx6Q9JKK1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stx6Q9JKK1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stx6Q9JKK1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stx6Q9JKK1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stx6Q9JKK1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stx6Q9JKK1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stx6Q9JKK1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stx6Q9JKK1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Stx6Q9JKK1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stx6Q9JKK1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stx6Q9JKK1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stx6Q9JKK1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stx6Q9JKK1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stx6Q9JKK1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stx6Q9JKK1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stx6Q9JKK1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stx6Q9JKK1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stx6Q9JKK1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stx6Q9JKK1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Stx6Q9JKK1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stx6Q9JKK1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Stx6Q9JKK1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stx6Q9JKK1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stx6Q9JKK1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stx6Q9JKK1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Stx6Q9JKK1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stx6Q9JKK1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stx6Q9JKK1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stx6Q9JKK1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stx6Q9JKK1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stx6Q9JKK1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stx6Q9JKK1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stx6Q9JKK1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stx6Q9JKK1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Stx6Q9JKK1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stx6Q9JKK1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stx6Q9JKK1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stx6Q9JKK1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stx6Q9JKK1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stx6Q9JKK1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stx6Q9JKK1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stx6Q9JKK1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stx6Q9JKK1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stx6Q9JKK1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Stx6Q9JKK1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stx6Q9JKK1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stx6Q9JKK1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stx6Q9JKK1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stx6Q9JKK1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stx6Q9JKK1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stx6Q9JKK1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stx6Q9JKK1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stx6Q9JKK1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stx6Q9JKK1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stx6Q9JKK1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stx6Q9JKK1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stx6Q9JKK1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stx6Q9JKK1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stx6Q9JKK1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Stx6Q9JKK1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stx6Q9JKK1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stx6Q9JKK1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stx6Q9JKK1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stx6Q9JKK1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stx6Q9JKK1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms