Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc9a3r2Q9JHL1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc9a3r2Q9JHL1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a3r2Q9JHL1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms